（一）發展定位
充分發揮對臺合作優勢，堅持走特色化、國際化發展之路，全市統籌資源配置，高起點規劃，從做大產業規模著手，逐步形成以生物醫藥為主體，創新研發和成果轉化為覈心，新藥及醫療器械、基因產業、中藥研發、健康產業為重點，引進新藥、高端仿製藥及先進醫療器械為切入點，近期佈局與長遠規劃相結合的產業佈局。
（二）發展目標
充分利用莞臺兩地發展生物技術產業的資源與優勢，集全市之力，積極爭取省乃至國家的資源，把莞臺合作生物技術產業基地建設為國家生物技術產業基地，成為國內一流、國際知名、特色鮮明的生物醫藥快速研發與轉化基地。
（三）功能佈局與用地規劃
基地規劃占地面積8200餘畝。規劃設定為8個園區，分別為：創新生物科技園、醫療器械產業園、生物技術產業園、健康產業園、臺灣特色園、國際總部園、生物製造園及中醫藥產業園。松山湖作為基地覈心啟動區先期開發建設。
（四）運營模式
基地採取國資公司主導的管道開發建設和運營管理。“政府引導，公司運作，莞臺合作，國際拓展，財政扶持，平臺支撐，統一規劃，專業運營，社會參與，滾動開發。
